如果拖拉机冷却系统不及时清理，系统内的冷却液中会积累大量的杂质和污垢。这些杂质和污垢会阻塞冷却液的流动，导致冷却效果下降。当发动机运行时，无法有效地散发热量，温度会不断上升。长时间高温运行会导致发动机过热，甚至引发发动机爆缸、发动机缸体开裂等严重损坏。
拖拉机冷却系统内的杂质和污垢还会腐蚀金属管路和发动机中的零部件。随着时间的推移，金属管路可能会出现漏水、破裂等问题，导致冷却液泄漏。而发动机中的零部件如水泵、散热器等也会受到腐蚀和损坏，进一步影响冷却系统的正常工作。
此外，拖拉机冷却系统不及时清理还会影响燃油的燃烧效率。当发动机过热时，燃油无法完全燃烧，会产生有害物质，如一氧化碳等。这些有害物质会直接排放到大气中，对环境造成污染，并且会降低发动机的动力输出。
如果拖拉机冷却系统不及时清理，还会影响拖拉机的使用寿命和维修成本。发动机过热和零部件损坏会导致拖拉机频繁维修和更换零件，增加维修成本。而拖拉机的使用寿命也会因为长时间高温运行而缩短，需要提前报废或进行大规模的维修。