农业防治：有机肥施加前进行充分腐熟，冬季田间保持灌水状态，淹死虫蛹。
生物防治：利用乌药、马醉木等植物制作杀虫剂，于羽化前全面浇灌，或者是利用白僵菌等微生物进行防治。
化学防治：使用辛硫磷或甲基异柳磷进行防治，可喷雾、灌根防治，亦可拌土撒施防治。
一、金针虫如何防治
1、农业防治
施肥合理施用腐熟不带虫卵的粪肥，翻土要精细，这样可以发现去除一些蛹。然后就是要在冬季一直保持灌水状态，淹死虫蛹。让它不可在第二年羽化成虫，这样就可以减少一些虫量。
2、生物药剂
使用乌药、马醉木等植物熬制做成中药剂，这样就可以在羽化前在土壤上全面浇灌毒杀虫蛹，平时可以随时使用这种药剂灌根杀死危害幼虫。或者是使用微生物菌类寄生杀死虫子，比如白僵菌，这些菌类寄主较多，可以同时防治其他地下害虫。比较安全有效。
3、药剂
使用辛硫磷、甲基异柳磷这两种药剂效果最好，可以直接喷雾，也可以拌土撒施，这样效果更好，但最直接有效的方法就是直接兑水配制成一定溶液灌根，直接毒杀根部危害幼虫。其他还有许多药剂可选择，只要选择药害较小的就好。
二、金针虫的危害症状
1、在土壤中，先是啃食刚播种的种子，使种子残缺不发芽。需要补种，后期如果种子萌芽了，就继续啃食幼亚或是幼苗，咬断幼苗根茎基部，使幼苗直接死亡。
2、如果成株的就主要啃食根系，让植株生长缓慢，根系残缺，营养吸收不良。如果是膨大类根茎，还会蛀食根茎内部，造成 空洞遇水腐烂。
三、金针虫的传播方式
1、虫害主发地在长江以北地区，干旱地区虫害严重，干旱浇水多发病最重。南方虫害较少。
2、通常虫子是三年发生一代。在地下成熟幼虫化蛹造虫室越冬，第二年温度回升后产卵孵化危害。
3、发生期不稳定，多重叠危害。一般靠成虫产卵传播，蛹虫卵可以随灌溉流水传播。
4、温度和水分决定虫害的发生轻重。春季多雨，虫卵死亡多，虫害少。