小麦黑穗病可用40%五氯硝基苯按麦种重量的0.5%的药量干拌（即每亩40克，拌小麦8公斤左右）防治；也可选择6%戊唑醇（立克秀）悬浮剂一袋（10毫升），加水0.8-1斤，拌种50-70斤，或2.5%氟咯菌腈（适乐时）悬浮剂按推荐剂量进行小麦种子拌种防治。
小麦黑穗病的防治方法:用15%粉锈宁斤种克药干拌预防。
提前拌种预防，防早期蚜虫用吡虫啉，噻虫嗪！防地下害虫用辛硫磷，防全蚀病用硅噻菌胺或苯醚甲环唑等！防纹枯病，黑穗病用戊唑醇，苯醚甲环唑，咯菌腈等！出穗提前喷施三唑酮，戊唑醇防治。
防治小麦黑穗病提前拌种预防。