病菌以菌丝体、分生孢子器及子囊壳在枝干病组织内越冬。在生长季节均有病菌孢子飞散传播，从各种伤口及死亡组织侵入，也能从皮孔、叶柄痕和果柄痕侵入。
病原菌在病部组织内越冬，早春树液流动时病菌开始活动和侵染，病菌靠风，雨水传播，但病菌为一种弱寄生菌，不能直接侵入寄主体内，只能通过冻伤、虫伤、日伤、修剪伤口等伤口侵入。梨树腐烂病多发生于主干主枝上，小枝较少发生，枝干阳面发病较多，阴面发病少，在树干分杈地方易发病，春季3月～5月发病最多，其次为6月～7日、9月底停止发展。梨树腐烂病的轻重与栽培管理有密切关系：如修剪过重、施肥不足、土壤粘重、排水不良、树势衰弱、低温、高湿、高温、地下水位高，不合理灌溉等发病都严重。