叶片发病：初期叶片上出现水渍状小点，叶片上病斑呈近圆形或不规则形，初为水渍状，后为淡灰褐或红褐色，干枯，边缘有黄色晕圈。潮湿时病斑上有粉红色黏稠物，干燥时病斑易开裂穿孔。严重时，病斑汇合成大斑，病部长出小黑点。果实染病：初呈水渍状、浅绿色、椭圆形病斑，病部稍凹陷，上生有轮纹状黑色或橙红色小点，后期病斑产生粉红色黏稠物，易开裂。瓜蔓和叶柄发病：病斑产生黄褐色长条形病斑，稍凹陷，高温高湿时病斑上有粉红色黏稠物。
黄瓜炭疽病主要危害叶片和果实。幼苗至成株均可发病。幼苗期发病在子叶边缘处生半圆形病斑，呈褐色至红褐色，稍凹陷。茎蔓基部黑褐色缢缩，幼苗倒伏。