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南瓜蔓枯病为害叶片、茎蔓和果实。叶片染病,病斑初褐色,圆形或近圆形,大小10~20毫米,其上微具轮纹。蔓枯病病斑椭圆形至长梭形,灰褐色,边缘褐色,有时溢出琥珀色的树脂状胶质物,严重时形成蔓枯,致果实朽住不长。
南瓜蔓枯病初期产生水渍状病斑,后期变褐色枯死。