玉米锈病主要侵染玉米的叶片，严重时叶鞘、苞叶及雄穗亦可受害。初期仅在叶片两面散生黄褐色夏孢子堆，玉米锈病后期则病部可产生棕褐色冬孢子堆。病初期显微镜检病原物可以观察到椭圆形或近亚球形浅褐色的夏孢子。
叶片两面初生淡黄白色小斑，四周有黄色晕圈，后突起形成黄褐色乃至红褐色疱斑，散生或聚生圆形或长圆形，即病菌的夏孢子堆。孢子堆表皮破裂后，散出铁锈状夏孢子。后期病斑或其附近又出现黑色疱斑，即病菌的冬孢子堆，长椭圆形，疱斑破裂散出黑褐色粉状物。发病严重时，整张叶片可布满锈褐色病斑，引起叶片枯黄，同时可危害苞叶、果穗和雄花。
⽟⽶锈病主要侵害⽟⽶叶⽚，严重时也可侵染果穗、苞叶乃⾄雄花。发病初期在叶⽚基部和上部主脉及两侧，散⽣或聚⽣淡黄⾊点，后突起形成红褐⾊疱，即病原夏孢⼦堆。后期病形成⿊⾊疱，即病原冬孢⼦堆。⽟⽶锈病发⽣严重时，叶⽚上布满孢⼦堆，造成⼤量叶⽚⼲枯，植株早衰，籽粒不饱满，导致减产，轻者减产10%-20%，重者达30%。更重时，造成叶⽚从收害部位折断，全株⼲枯。