新鲜人粪尿呈中性，含氮多，而磷、钾少，使用时应配合施磷、钾肥。长期单用会破坏土壤结构，引起土壤板结。因此必须经发酵腐熟后施用，一般经10~15天的贮存才会腐熟。贮存用的粪池应选择在较荫蔽的地方，不能漏水，应有盖（防氨挥发）；加2~3%的过磷酸钙，能起到固氮保肥作用，同时也可补充磷素而提高肥料质量。
人的尿液与粪便必须发酵以后才能做肥料，没发酵的没有多少肥效。
人尿粪必须经过发酵处理灭菌之后才能施用。
人粪尿不可以同草木灰一赶施用。起化学反应，降低二者的肥效。
应腐熟发酵半个月灭菌后再施用。
首先，不宜施新鲜人粪尿，要经贮存腐熟再施入土壤。再次，不宜单施人粪尿，而应配合磷钾肥，以防引起土壤板结等。最后，人粪尿施时不能地表直接泼撒，而要开沟或穴并立即覆土以防氨的挥发而降低肥效。
必须经过发酵腐熟才可以使用，否则没有效果。