加强病虫害防治和田间种植管理。
种子处理，合理轮作，嫁接，化学防治。
一是采用嫁接苗，二是尽量不用重茬地，三是及时排除积水，四是地膜覆盖，五是对症下药及早预防。
选择抗品种，合理轮作，防治病虫害。
西瓜枯萎病发病初期可选用50%代森胺水剂5001000倍液，或70%甲基托布津可湿性粉剂5001000倍液，或25%咪鲜胺（施保克）乳油10001500倍液，或50%立枯净可湿性粉剂800倍液，或60%百菌通500倍液等，喷雾与灌根相结合，每株灌药液250500毫升，每隔78天1次，连续防治西瓜枯萎病35次。
应以预防为主综合防治西瓜枯萎病。