病原物是芸薹链格孢菌，属半知菌亚门真菌，病菌主要丛生于叶片两面，浅褐色，分生孢子梗橄榄褐色，分生孢子多呈链生，有时分枝，浅褐色至暗褐色。病菌多在病残体及土壤里越冬，外界条件适宜时，病菌萌发侵染西兰花，病部产生的分生孢子在田间借风进行多次再侵染。
初步观察以菌丝体及接合孢子随病残体在土壤中越冬，翌年春季条件适宜时产生孢子囊和孢囊孢子，借风雨传播，侵染西瓜、甜瓜等多种植物，引起花、果腐烂，在病花、病果表面产生大量孢子囊和孢囊孢子，对西瓜花和果实进行多次重复侵染，致该病在田间不断扩展。西瓜花期幼果期进人感病阶段，此间遇高温多雨或雨后湿气滞留常引起该病严重发生。
西瓜花期幼果期进人感病阶段，此间遇高温多雨或雨后湿气滞留常引起该病严重发生。西瓜花腐病的防治方法，尚未完全明确，初步观察以菌丝体及接合孢子随病残体在土壤中越冬，翌年春季条件适宜时产生孢子囊和孢囊孢子，借风雨传播，侵染西瓜、甜瓜等多种植物，引起花、果腐烂，在病花、病果表面产生大量孢子囊和孢囊孢子，对西瓜花和果实进行多次重复侵染，致该病在田间不断扩展。
西瓜花腐病主要是湿度过高引起的。