可以采用中生菌素或者叶枯唑进行防治。
01施足基肥，以提高抗病力；雨后及时排水，株行间通风透光。02保护地栽培棚内，及时清理沟系，防止雨后积水，适时通风换气，以免给病害产生提供好的条件；要经常通风换气，降低叶面湿度，减少侵染机会；肥水管理采取轻浇勤浇，浇水施肥应在晴天的上午，并及时开棚通风降湿。03如果每年发生都严重的地块，建议3年以上的倒茬种植。提倡与非葫芦科作物实行隔年轮作，以减少田间病菌来源。04在病害盛发期及时摘除病老叶，收获后清洁田园，清理病残体，并带出田外深埋或烧毁，深翻土壤，加速病残体的腐烂分解。
西瓜叶枯病在防治上必须抓好种子消毒，选用抗病品种，实行轮作，及时清除杂草，合理密植，防止瓜秧过于繁茂。加强温室通气，把空气相对湿度降至70%以下，增施磷钾肥和有机肥料，减少氮肥施用量，科学用药等综合措施，才能取得较为理想的防治效果。