香蕉细菌性枯萎病病原为茄青枯拉尔氏菌2号生理小种或野油菜黄单胞芭蕉致病变种。病菌经切割吸芽的伤口侵入时发病，表现为幼龄植株的嫩叶迅速黄化、萎蔫，假垄变色，全株迅速枯萎。成株染病则叶柄坏死，叶片萎蔫并从里层向外层相继干枯下垂，果实停止发育，畸形、变黑、皱缩。病菌由昆虫传播，经雄花序侵入时发病，一般看不到外部症状，至结实时，可见雄花芽变黑、萎缩，果实常在成熟前变黄色。切开检查，横切面有菌脓溢出，果肉僵硬，褐色干腐，果皮开裂，最后整个花穗腐烂，变成黑色。
香蕉细菌性枯萎病是维管束病害，各发育阶段均感病。幼年植株感病，迅速萎蔫而死亡，中间叶片锐角状破裂，不变黄。成株期感病，首先内部叶片近叶柄处变脏黄色，叶柄崩溃，叶片萎蔫而死亡，同时从里到外的叶片逐渐脱落、干枯，根出条开裂，叶鞘变黑。感病植株若开始结果，果实停止生长，香蕉畸形，变黑皱缩。若仅成熟的果实感病，外部可能没有症状，果肉变色腐烂。感病假茎横切面可见维管束变绿黄色至红褐色，甚至黑色，尤其是里面叶鞘和果柄、假茎、根围及单个香蕉上均有暗色胶状物质及细菌菌溢。香蕉果肉最终当果皮开裂后形成灰色干腐的硬块。