1、独头蒜和大蒜外观不同。独头黑蒜比多瓣黑蒜大，独头黑蒜为一瓣，而多瓣黑蒜有两种品种：十二瓣黑蒜；十四瓣黑蒜2、独头蒜和大蒜口感不同。独头黑蒜比多瓣黑蒜更甜更酸，而且比多瓣黑蒜好食用。3、独头蒜和大蒜营养价值不同。因独头生蒜可以入药，独头黑蒜的营养价值比多瓣黑蒜高4、独头蒜和大蒜发酵时间不同。独头黑蒜因一瓣比起多瓣黑蒜的其中一瓣大，发酵时间、发酵工艺有所不同。
独蒜和大蒜区别在于独蒜伸张的时候把所有的蒜瓣融合到一起去了，形成一个巨大的蒜坨。大蒜一般是有6-10个蒜瓣组成，可以理解为独蒜是大蒜发生了性状突变，这与自身基因以及生长环境都有关系，独蒜所含的蒜素更多，更适合制药。
大蒜与独头蒜外观不同，营养是一样的。